Salut,
Tu dois pouvoir régler la synchro flash sur le départ du second rideau, ie juste avant la fin de la photo (détails à voir dans ta notice, je ne connais pas le D5000 — j'espère que c'est possible sur ce boîtier).
En revanche, à ma connaissance, aucun boîtier ne permet de déclencher un flash à un moment particulier, non. Pour ça, il te faudrait un flash externe que tu déclencherais manuellement.