Le seul format d'archivage permettant de garder la qualité initiale et la possibilité de retraiter avec un autre logiciel ultérieurement est le format RAW.
La problématique d'espace disque est un faux problème désormais vu le prix des disques, à 100 euros le To t'as de la marge ...
Pour des raisons de compatibilité ultérieure, bien que le RAW Nikon soit aussi pérenne que la marque qui le produit, je conseille le Tiff non destructif (LZW) mais qui prends beaucoup de place aussi.
Le JPG est à déconseiller, tu ne pourras rien en faire d'autre que le tirer en l'état, on ne retouche pas un JPG sans le dégrader.
Le DNG est un format non encore universel même s'il s'en approche, et tu perdras au passage les critères propres à Nikon stockés dans le RAW (réglages du boîtier par ex.).
Au final, va chercher une baie disque et stocke tout, c'est encore le plus simple. En prenant soin de dupliquer les sauvegardes "au cas où" ...