Oublie le mode M, ça revient juste à devoir régler deux paramètres indépendamment (vitesse et ouverture), alors que les modes A et S te renvoient automatiquement l'autre valeur.
Le mode M est utile en macro pour certaines applications (et selon l'intention), comme le time lapse ou le focus stacking, car il permet précisément de s'affranchir des ajustements automatiques et donc de conserver une valeur d'exposition strictement invariable, même si les conditions de lumière changent.
Mais pour des photos macro "standard", les modes A et S conviennent parfaitement. Il te reste juste à décider si tu veux privilégier la vitesse ou l'ouverture.