Le D5000 est compatible CLS, mais avec quelques limitations.
La plus notable est que le boitier ne sait pas piloter des flashs distants sans fil et sans accessoires, contrairement aux boitiers des gammes supérieures.
En revanche, la plupart des fonctions CLS sont disponibles avec un flash compatible (dont le SB700) monté sur la griffe flash du boitier.