c'est vrai qu'en paysage il est rare qu'on utilise le flash mais je pose quand même la question : c'est normal 
Le flash intégré est très proche de l'optique, suivant les optiques utilisées, le pare soleil peut faire de l'ombre à l'image. C'est logique imagine que je place un 600 F4 devant ton boîtier ton petit flash sera masqué par le diamètre de l'optique.
Donc le petit flash intégré n'est pas adapté à toutes les optiques. Essaye déjà sans le pare soleil, mais de toute façon je te conseille d'apprendre à te passer du petit flash intégré qui donne très rarement de bon résultats

PS: Pour nettoyer ton capteur n'utilise surtout pas la manière que tu as utilisée en plaçant ton boîtier en pose, il y a une fonction dédiée pour cela, cela t’éviteras un éventuel accident comme une batterie vide et une fermeture du rideau précipitée.