Tout ça me paraît parfaitement normal.
Lors de l'import, LR stocke sur ton ordi les fichiers NEF et il crée des aperçus basés sur ces NEF selon le réglage que tu as fait, la taille de l'aperçu peut varier et le délai de création aussi.
Ensuite, quand tu affiches une photo, si l'aperçu existe alors c'est lui qui est affiché, sinon c'est la vignette JPG intégrée par le D700 dans le NEF. LR utilise cette vignette pour prévisualiser les photos (c'est elle que tu vois quand tu es dans l'écran d'import par exemple).
Si l'affichage ensuite n'est pas bon, c'est que :
- soit l'aperçu LR n'est pas créé, vérifie le réglage de LR
- soit tes réglages boîtiers sont tels que le JPG généré est mauvais, vérifie tes réglages boîtiers
J'utilise le couple D700+LR sans souci, et les aperçus sont conformes. Mais il est normal que l'aperçu change au bout de quelques secondes puisqu'au début tu as l'aperçu du JPG boîtier puis dès que l'aperçu LR est créé, c'est lui que tu vois.