Normalement, la vitesse est suffisante (je suppose que tu as fait tes essais sur un sujet immobile).
As-tu ce genre de problème à pleine ouverture ou à toutes les ouvertures? Si tu obtiens de meilleurs résultats au flash, c'est peut-être simplement que, du fait de l'utilisation du flash, tu fermes davantage. Et donc la PDC plus importante "masque" le problème de mise au point. Ca peut faire penser à un problème de front/back focus.
J'ai eu ce souci sur mon D300, mais il m'a été possible de le récupérer grâce au réglage précis de l'AF. Cette fonction n'existant pas sur le D200 (et si le problème est bien celui-là) il faudra faire régler ton zoom.
Pour te faire une idée précise, il faudrait faire un test comme celui-ci:
http://www.focustestchart.com/focus21.pdf