Je me suis posé exactement la même question quand j'ai voulu passer au reflex : D5500 ou D7200?
Et finalement j'ai un D7100...
Niveau qualité d'image et montée en ISO, il y a peut être un léger avantage pour les plus récents D5500 et D7200, mais probablement négligeable.
Ce qui me gène sur le D5500 : une seule molette de réglage, donc trop long pour des réglages rapides en manuel ou priorité ouverture (l'écran tactile, perso pas mon truc).
Sur les D7xxx tu as tout sous la main et tout est paramétrable. Alors oui ça impose de connaitre l'utilité de chaque bouton, mais franchement régler les iso, le mode autofocus, l'ouverture, la correction de luminosité etc... en une seconde et sans lever l'oeil du viseur, c'est un énorme avantage pour moi. (si ça te parle pas encore tu comprendras rapidement l'intérêt si tu cherches a sortir du mode automatique)
Tu as aussi deux cartes SD, et une meilleure solidité. Et comme déjà dit, tu te poses pas de question de compatibilité d'AF avec les objectifs.
Sinon pourquoi un D7100 et pas D7200? Parce que pour moi les avantages sont minimes, voir gadget (je n'utilise pas le wifi et m'en porte très bien), alors que le prix change beaucoup, puisque la sortie du 7200 a fait tomber le prix du 7100.
Le seul petit regret est l'écran orientable du D5500 pour prendre des photos dans des situations particulières (ras du sol, au dessus des têtes), mais bon c'est pas non plus tous les jours que ça sert