Des tests en AF-S seraient plus probants à mon avis.
Le boitier faisant toujours ses mesures à PO, les paramètres vitesse, ouverture et mode (PSAM....), n'ont AUCUNE incidence sur le calage de l'AF!
Le collimateur central est le plus sensible, mais il doit être sur une zone contrastée quand même. Quand on fait des tests on a des fois tendance à lui en demander trop à ce pauvre AF
Juste une expérience personnelle, c'était aussi sur D700, mais cela peut s'appliquer aux autres boitiers, j'avais des hésitations d'AF avec plusieurs objectifs, et en observant et nettoyant la chambre j'avais remarqué une poussière (visible à l'oeil nu) sur le miroir secondaire, celui qui sert aux mesures et qui est visible en soulevant légèrement le miroir principal. Je ne dit pas que c'est çà! mais ça m'est arrivé au moins une fois

C'est vrai aussi que mon 300f/4 AF-S n'est pas aussi réactif qu'un 300f/2.8 (.... que j'ai seulement essayé

) et que des fois ... il se plante......