Oui, il faut envisager un nettoyage manuel :
Après avoir enlevé l'optique et avoir remonté le miroir (voir le manuel du boitier).
Commence par essayer de t'en débarrasser avec une poire à air (puis photos d'essai pour vérifier)
A ce stade, il n'y a aucun risque si tu suis bien la procédure indiquée dans le manuel.
Ensuite, tu peux soit amener ton boitier chez ton revendeur (nettoyage en général payant, renseignes-toi sur le tarif), soit passer Chez Nikon Beaumarchais si tu habites en région parisienne, soit continuer par tes propres moyens.
Tu peux ensuite essayer avec des moyens sans contact plus "violents", bombe à air sec avec précautions et/ou aspirateur ménager à sa plus faible puissance.
S'il s'agit d'une tâche grasse ou adhérente, il faut passer au nettoyage humide avec contact. Il existe des kits de nettoyage, comme le kit Eclipse
http://www.digit-photo.com/Entretien-aFA0060/PHOTOGRAPHIC_SOLUTIONS_Kit_K2_Nettoyage_Capteur_Eclipse-rREIDLIMAGINGK2.html , et d'autres similaires.