Bonsoir et bienvenue. 
Si le viseur est très sombre, il est bien possible que la sélection du diaphragme ne se fasse plus et que tu sois à ouverture réelle. 
Conséquence : l'AF n'arrive plus à faire la mise au point et le boitier, s'il est réglé en priorité à la mise au point (réglage "d'usine") ne veut plus déclencher. 
D'après ta description, tu soupçonnes le TC. As-tu fait des tests croisés ? 
- voir si c'est identique avec le 70-200 seul (sans le TC). 
- voir si c'est identique avec une autre optique (toujours sans le TC)
- voir si c'est identique avec le TC monté sur une autre optique. 
- Si tu as un autre boitier à disposition, mêmes test avec cet autre boitier. 
Pour les causes : ce pourrait être un mauvais contact électrique ; ou un problème sur la came de diaphragme (ou, moins probable, sur le diaph lui-même).