Parce que Power Point n'est pas un standard en matière de diaporama photo et qu'il implique l'installation du logiciel alors que PTE délivre un exécutable directement 
D'autre part pas envie de payer une licence Office pour jouer un simple diaporama 
Oui mais un exécutable .exe c'est certainement pas un standard

Il existe aussi OpenOffice qui permet de faire des présentations dans un format ouvert, libre et gratuit. Pas de taxe à Billou et en règle de licence.
Il permet de sauver le travail en PDF avec des effets de transitions.
Pour le problème de projection, il est aussi possible que la résolution du pc n'est pas celle du projecteur, il y a donc un travail d'adaptation à faire par le projecteur qui ne suit peut-être pas.
Si c'est plutôt des effets de fréquences lors des transitions d'images, c'est peut-être la roue chromatique du vidéo-projecteur qui n'est pas suffisamment large et qui provoque des saccades. Pour éviter cela il faut en général un vidéo-projecteur avec une roue chromatique à 5 segments.
Voir aussi le câblage, j'ai déjà eu des problèmes de couleurs qui partent/reviennent suite à des défaut de connecteur. Si tu bouges légèrement les câbles de connexions ou prises de connexions et que des couleurs partent en saccade c'est un problème de câble ou de prise de câble ou pire de soudure de la sortie vidéo du portable (problème fréquent).
Il est aussi possible que la carte graphique ne suive pas l'affichage sur deux écrans. Il faut parfois désactiver l'écran du portable (dans le cas des portables).