Oui, c'est bien ça, le réglage sur 1/250 ou 1/320 n'intéresse que le flash intégré.
Malgré une vitesse synchro de 1/250, le flash intégré peut être "poussé" à 1/320 (mais pas plus) en choisissant 1/320 dans le menu.
Sinon, pour les flashes Cobra, ça ne change strictement rien. Quel que soit le réglage, ils peuvent monter jusqu'à la vitesse la plus rapide permise par le boitier, soit 1/4000 ou 1/8000.
Manuel du D7100, p. 245 :