Si j'ai bonne mémoire, le D40 embarque le même capteur 6 Mpx que le D70, qui ne brille pas par sa montée en sensibilité.
Le D90 permet de monter jusqu'à 1600 ISO sans que le bruit soit gênant.
Un capteur plus dense de 12 Mpx permet (théoriquement) une image plus détaillée si l'optique est à la hauteur.
Je ne sais plus quel sont les modules AF embarqués dans ces boitiers, mais une amélioration des performances de l'AF est aussi assez probable.
Il y a probablement un obstacle financier, mais pourquoi ne pas envisager carrément un D7000 (éventuellement d'occasion)?