Bonjour,
Sans pouvoir confirmer mes déductions, je pense que c'est la manière dont le logiciel lit le fichier Nef, contrairement à d'autres RAW, le Nef inclus les infos d'optimalisations appliquées, Nikon Capture par exemple lit et applique tous ces paramétrages, d'autres non, est-ce que l'un de tes logiciels lit ça en partie? Aussi chaque logiciel a ses paramétrages, il faut qu'ils sont configurés 100% de la même manière (profil couleur, compression, etc...)