tu as été induit en erreur dans ce cas par les répertoires y faisant référence, en effet si aucune trace d'installation, il est à parier qu'il ne s'y trouve pas, pour t'en convaincre suffit de vérifier les processus en cours, de plus rien d'irréversible au final, quoi qu'il en soit, suffit de réinstaller ce qui aurait été perdu...
En principe on garde le backup du jour précédent lorsqu'on effectue une mise à jour du système, au cas où...