Mouais, autant je suis d'accord sur le fait d'avoir un disque dur dédié système est plutôt une bonne idée, avoir un disque de travail ET un disque de stockage me parait un peu excessif en tout cas luxueux pour une utilisation non pro.
Par contre faire deux partitions sur le deuxième disque pour séparer espace de travail et espace de stockage permet de bien distinguer les deux.
Enfin pour le disque de sauvegarde, j'aurais tendance à privilégier une solution externe pas forcément reliée en permanence. Plus prudent. Si un jour le PC rencontre un soucis électrique, le dd externe à plus de chance d'être épargné.
A noter qu'augmenter la mémoire vive a de toute façon de bien meilleure chance d'améliorer les performances que d'ajouter des disques durs. 4 Go pour une config neuve sous 64 bits c'est un peu dommage :-)