Juste pour corriger quelques approximations...
Le capteur du D1x a 10,8 millions de photosites, mais comme ils sont groupés deux à deux dans le sens vertical, il lui reste 4028 x 1324=5,33M de "pixels bruts".
Les images étant donc plutôt applaties, le processeur interne et certains développeurs RAW réduisent la résolution horizontale et interpolent la verticale pour arriver à 3008 x 1960 pixels.
Il y a donc perte dans un sens et interpolation dans l'autre.
Plutôt que de réduire la résolution, certains programmes "malins" (Bibble le premier) ont au contraire doublé la résolution verticale par interpolation pour revenir environ à la résolution originelle (4016 x 2616).
L'interpolation est plus importante dans un sens mais dans l'autre on ne perd aucune information.
L'impact de cette interpolation dépend du type de photo et de la qualité du dématriceur.
Mon expérience personnelle est que pour la plupart des photos la qualité est excellente avec Capture NX ou Lightroom 3.