Les deux boitiers partagent le même capteur, donc le résultat photographique de l'un et de l'autre seront très proches.
le D90 propose des "modes résultats" facilitant la vie des débutants, il est (un peu) plus compact et léger.
Le D300 permet d'accéder rapidement aux principaux réglages sans passer par les menus, il offre la mesure de lumière avec les optiques manuelles, sa structure est metallique.
Tous deux sont utilisables en mode tout-automatique (P+AF+ISO auto), nécessitent une lecture approfondie du mode d'emploi, et permettent de débrayer chaque automatisme pour qui veut faire "par soi-même".
Le mieux est encore de les prendre en main et garder celui qui donne la meilleure sensation.