Le RAW ou NEF chez Nikon, ce n'est pas une image. Ce sont les données brutes du capteur. Maintenant, la plupart des OS savent interpréter les données pour en afficher une image. Il est de loin préférable d'utiliser le format RAW ou RAW + JPEG. Comme l'a écrit El Diablo, le RAW contient bien plus d'informations. Avec toutes ces informations supplémentaires, tu peux (dans la mesure du raisonnable) récupérer le bleu du ciel là où il est tout blanc en JPEG (ciel cramé). Tu peux aussi récupérer des détails dans une robe de marié toute blanche ou encore récupérer les informations dans les zones les plus sombres. En gros, le fichier RAW, c'est comme un document WORD où tu peux tout modifier et le JPEG c'est le PDF créé à partir du document WORD, où tu ne peux pas faire grand chose.
Pour commencer, utilise le RAW + JPEG. Le jour où tu voudras retravailler les fichiers RAW, tu pourras le faire. Moi j'ai fait du JPEG pendant 2 ans et je ne peux donc pas faire grand chose avec les JPEG. Depuis presque 10 ans, je fais du RAW + JPEG (juste au cas où j'ai un soucis avec la carte mémoire, car les logiciels de récupération savent récupérer les JPEG, mais plus difficilement les RAW).
Le mode AUTO est pour les débutants. Dès que tu auras compris à quoi correspond le temps de pose, l'ouverture du diaphragme et les ISO, tu pourras commencer à utiliser les modes semi-auto comme le mode S et le mode A. Le mode P est un intermédiaire entre les modes A/S et le mode AUTO. Le mode M est le mode où tu règles les 3 paramètres cités. Fait des essais avec les différents modes et regarde ce qui change (profondeur de champ, bruit numérique, flou de bougé...). Prend en photo des sujets immobiles et des sujets qui bougent. Lis la notice avec les exemples.
Il est possible que Linux n'interprète pas correctement le RAW. Pour le logiciel GIMP, il faut ajouter le plug-in UFRAW. Je le trouve trop basique. Il a peut-être évolué depuis mon essai il y a quelques années. Il y a aussi les logiciels Darktable et Rawtherapee sous Linux.
Sur ta photo RAW, il y a sans doute des corrections de distorsion de l'objectif qui sont appliquées, d'où ces zones noires un peu incurvées. Il faut recadrer la photo pour enlever ces bords. Là aussi, tous les logiciels sérieux savent le faire automatiquement.