Personnellement, j'utilise Lightroom qui, depuis sa version 6, permet d'assembler des photos en panoramiques.
L'avantage est que tu peux assembler des RAW, et donc ensuite agir sur le RAW pour le traitement.
Avant, j'utilisais Panorama Maker, mais il n'assemble que des jpeg, ce qui oblige à traiter le RAW avant assemblage, ou bien d'accepter de traiter du jpeg après assemblage, ce qui n'est pas logique dans les 2 cas, à mon avis.
Concernant les paysage de mer, le problème est que les vagues avancent entre 2 photo, donc le décor bouge, ce qui rend difficile l'assemblage, et ce qui crée donc des jointures visibles. Personnellement j'évite les panoramiques avec un paysage "en mouvement" comme une mer avec des vagues.
Quand tu dis "difficulté à retranscrire la ligne d'horizon", cela signifie-t-il que l'horizon n'est pas droit ? Qu'il est bombé ? Dans ce cas, le problème pourrait venir plutôt de la prise de vue. D'autant plus si tu utilises un grand angle.