J'ai eu le même problème avec un 35mm DX.
Il allait nickel sur mon D5100, et nécessitait un micro-réglage à -19 sur le D7000 !
Le 85mm, lui, allait aussi bien sur le D7000 que sur le D5100 (pas de micro-réglage).
Je suis passé à l'Espace Nikon (lors d'un voyage à Paris), qui m'a dit que le 35mm et le boîtier avaient un back-focus, qui s'additionnaient.
Et d'ailleurs qu'à -19 (quand je lui ai demandé de vérifier, car il ne l'avait pas fait) tout allait bien.
Du coup, j'ai filé sans demander mon reste (le boîtier n'est plus sous garantie, et c'était 198€ pour le caler).
Comme le 35mm était encore sous garantie, j'ai pu l'échanger, pour voir si ce n'était pas tout simplement l'objectif lui-même.
Résultat : le nouveau nécessite un micro-réglage de l'ordre de -11 à -13 (ce n'est pas très facile à très bien régler ; j'ai fait la méthode de la mire, et la méthode DotTune), et j'en reste là.
Il y a pas mal de trucs sur des problèmes de focus avec le couple 35mm DX et le D7000 sur les forums US.
Par exemple :
http://www.dpreview.com/forums/post/40658943http://www.dpreview.com/forums/post/41879732http://www.dpreview.com/forums/post/37915885Cependant, pour moi c'est ok maintenant, tel qu'il est.
Il vaut mieux si possible éviter de se focaliser sur ces problèmes de focus, sinon on n'en sort plus, et on passe son temps à contrôler l'AF plutôt qu'à faire des photos (les forums font caisse de résonance, pour tous les problèmes).
Note aussi que le problème en question, quand il existe, est surtout crucial à grande ouverture et à courte distance, évidemment.
Et qu'il y a aussi pas mal de raisons pour lesquelles une photo peut être hors focus.
Tout ceci pour dire que, si c'est ok à -18 ou -20, je me demande s'il n'est pas plus sage de s'en contenter...