S'il y a un seul fichier à garder (pour des raisons de place) c'est le raw.
Si on dispose de volumes de stockage abondants, en plus du raw, le PSD avec calques permet de revenir plus facilement sur les traitements, sans repartir de zéro. A toi de voir si ça t'es utile ou non.
Lorsqu'on a passé 1/4h ou 1/2 h à détourer un sujet avec précision, conserver le PSD + calques me paraît être une bonne pratique. Si en revanche le temps de traitement sous PS ne dépasse pas quelques secondes, l'intérêt de sauvegarder le PSD + calques se justifie beaucoup moins. Tout dépend alors de la capacité de stockage dont on dispose, si on en est à économiser les Mo, ou si les limites sont quasi-infinies.
Edit : je conserve systématiquement le raw, le tiff 16 bits en sortie de mon dématriçeur, et le PSD avec calques. Je pourrais parfaitement supprimer le tiff, qui ne sert que de format de passage vers Photoshop, et gagner x fois 100Mo sur mon disque dur. N'ayant pas (encore) de problème avec mon volume de stockage, je ne le fais pas. Si/lorsque la question se posera, je sais que j'ai un gisement d'espace-disque considérable, que j'exploiterai le moment venu. Mais aujourd'hui, la question ne se pose pas. Et donc je ne me la pose pas.